一是感病嚴重的棉子。枯萎病、黃萎病是制約棉花產量的頑癥，而棉子又是病菌的載體，病菌可以隨著棉子迅速傳播，因此，枯萎病、黃萎病嚴重地區的棉種，不能調入感病輕的棉區，更不能調入無病棉區。

    二是伏前桃和晚秋桃棉子。伏前桃和晚秋桃生長發育不良，成熟度差，鈴重量輕，種子發芽率低，長勢弱。

    三是剝桃芽的棉子。有些棉農對發育較為充分的伏桃，仍然有搶墑剝桃花的陋習。凡剝桃芽的棉子，由于沒有充分成熟，不能做種。

    四是噴施了乙烯利的棉子。噴施乙烯利雖然可以促使棉花早熟３～４天，但對棉子損傷較大，致使其發育不全，不能做種。

    五是退化嚴重的品種。棉花是異交作物，異交率在８％左右，有些棉農多年沒有更換新的品種，棉種純度只有７０％～８０％，品質退化嚴重，繼續使用將會導致減產，品質下降。

    六是與農藥、化肥一起存放的棉子。有些農戶常常將棉子與農藥、化肥一起長期存放于一個倉庫，由于通氣不暢，農藥、化肥散發的有毒氣體會損傷棉子正常的生理，造成發芽率銳減。

    七是儲存年代過久的棉子。存放半年的棉種一般發芽率在８０％以上，在無低溫冷藏設備的情況下，棉種的壽命與儲存年代呈反比，即存放年代越久，棉種壽命越短。