此病在各銀杏育苗區均普遍發生。多出現于1～2年生的銀杏實生苗木，尤以一年生苗木更為嚴重，常造成幼苗大量死亡。

　　癥狀
　　發病初期幼苗基部變褐，葉片失去正常綠色，并稍向下垂，但不脫落。感病部位迅速向上擴展，以至全株枯死。病苗基部皮層出現皺縮，皮內組織腐爛呈海綿狀或粉末狀，色灰白，并夾有許多細小黑色的菌核。此病病菌也能侵入幼苗木質部，因而褐色中空的髓部有時也見小菌核產生。此后病菌逐漸擴展至根，使根皮皮層腐爛。如用手拔病苗，只能拔出木質部，根部皮層則留于土壤之中。銀杏扦插苗在高溫或低溫的條件下，莖腐病也能發生，可使插穗表皮呈筒狀套在木質部上，韌皮部薄壁組織則全部發黑腐爛。

        病原菌
　　銀杏莖腐病的病原菌為球殼孢目、球殼孢科，大莖點屬的炭腐病菌Macrophomiaphas～oli（Maubl）Ashby。此菌喜高溫，適宜。的生長溫度為30～32℃；而對酸堿度要求不嚴，在pH4～9之間均能很好生長。

　    發病規律
　　莖腐病菌通常在土壤中營腐生生活，屬于弱寄生真菌。在適宜條件下自苗木傷口處侵入。因此，病害發生與寄主和立地環境條件有關。苗木受害的根本原因是由于地表溫度過高，苗木基部受高溫灼傷后造成病菌侵入。苗木木質化程度越低此病的發病率越高。在苗床低洼積水時，發病率也明顯增加。銀杏扦插苗，在6～8月份當苗床高溫達30℃以上時，插后10～l5d即開始發病，嚴重時大面積接穗發黑死亡。試驗證明，拮抗性放線菌能有效的抑制該病病菌的蔓延擴散。